Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AGRPO00253 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGRPO00253 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGRPO00253 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGRPO00253 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGRPO00253 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
AGRPO00253 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGRPO00253 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGRPO00253 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGRPO00253 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGRPO00253 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AGRPO00253 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGRPO00253 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGRPO00253 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGRPO00253 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGRPO00253 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGRPO00253 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGRPO00253 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGRPO00253 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGRPO00253 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGRPO00253 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGRPO00253 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGRPO00253 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGRPO00253 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AGRPO00253 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AGRPO00253 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AGRPO00253 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
AGRPO00253 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGRPO00253 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGRPO00253 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGRPO00253 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGRPO00253 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGRPO00253 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGRPO00253 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGRPO00253 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGRPO00253 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGRPO00253 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGRPO00253 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGRPO00253 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AGRPO00253 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGRPO00253 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGRPO00253 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGRPO00253 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGRPO00253 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGRPO00253 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGRPO00253 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGRPO00253 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGRPO00253 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGRPO00253 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AGRPO00253 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGRPO00253 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGRPO00253 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGRPO00253 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGRPO00253 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGRPO00253 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGRPO00253 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AGRPO00253 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGRPO00253 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGRPO00253 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGRPO00253 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGRPO00253 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGRPO00253 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGRPO00253 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGRPO00253 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGRPO00253 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGRPO00253 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGRPO00253 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGRPO00253 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGRPO00253 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGRPO00253 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGRPO00253 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGRPO00253 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGRPO00253 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AGRPO00253 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGRPO00253 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGRPO00253 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGRPO00253 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGRPO00253 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGRPO00253 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGRPO00253 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGRPO00253 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGRPO00253 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGRPO00253 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGRPO00253 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGRPO00253 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGRPO00253 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGRPO00253 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AGRPO00253 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AGRPO00253 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGRPO00253 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGRPO00253 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGRPO00253 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGRPO00253 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGRPO00253 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGRPO00253 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGRPO00253 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGRPO00253 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGRPO00253 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AGRPO00253 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AGRPO00253 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms