Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF103O00237 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF103O00237 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF103O00237 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF103O00237 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF103O00237 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF103O00237 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF103O00237 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF103O00237 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF103O00237 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF103O00237 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF103O00237 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF103O00237 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF103O00237 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF103O00237 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF103O00237 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF103O00237 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF103O00237 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF103O00237 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF103O00237 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF103O00237 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF103O00237 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF103O00237 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF103O00237 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF103O00237 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF103O00237 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF103O00237 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF103O00237 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF103O00237 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF103O00237 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF103O00237 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF103O00237 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF103O00237 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF103O00237 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF103O00237 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF103O00237 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF103O00237 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF103O00237 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF103O00237 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF103O00237 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF103O00237 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF103O00237 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF103O00237 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF103O00237 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF103O00237 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF103O00237 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF103O00237 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF103O00237 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF103O00237 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF103O00237 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF103O00237 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF103O00237 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF103O00237 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF103O00237 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF103O00237 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF103O00237 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF103O00237 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF103O00237 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF103O00237 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF103O00237 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF103O00237 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF103O00237 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF103O00237 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF103O00237 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF103O00237 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF103O00237 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF103O00237 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF103O00237 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF103O00237 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF103O00237 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF103O00237 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF103O00237 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF103O00237 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF103O00237 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF103O00237 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF103O00237 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF103O00237 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF103O00237 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF103O00237 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF103O00237 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF103O00237 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF103O00237 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF103O00237 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF103O00237 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF103O00237 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF103O00237 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF103O00237 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF103O00237 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF103O00237 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF103O00237 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF103O00237 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF103O00237 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF103O00237 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF103O00237 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF103O00237 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF103O00237 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF103O00237 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF103O00237 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF103O00237 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF103O00237 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms