Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPSO00116 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGPSO00116 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPSO00116 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPSO00116 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPSO00116 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPSO00116 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPSO00116 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPSO00116 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPSO00116 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPSO00116 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPSO00116 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPSO00116 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPSO00116 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPSO00116 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGPSO00116 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPSO00116 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPSO00116 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPSO00116 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPSO00116 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPSO00116 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPSO00116 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPSO00116 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPSO00116 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPSO00116 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPSO00116 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGPSO00116 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPSO00116 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPSO00116 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPSO00116 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPSO00116 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPSO00116 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPSO00116 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPSO00116 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPSO00116 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGPSO00116 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPSO00116 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPSO00116 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPSO00116 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPSO00116 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPSO00116 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPSO00116 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPSO00116 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPSO00116 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGPSO00116 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGPSO00116 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGPSO00116 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGPSO00116 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGPSO00116 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGPSO00116 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGPSO00116 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGPSO00116 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AGPSO00116 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGPSO00116 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGPSO00116 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AGPSO00116 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AGPSO00116 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AGPSO00116 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AGPSO00116 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AGPSO00116 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AGPSO00116 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AGPSO00116 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGPSO00116 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGPSO00116 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AGPSO00116 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGPSO00116 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGPSO00116 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGPSO00116 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGPSO00116 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGPSO00116 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGPSO00116 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGPSO00116 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGPSO00116 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGPSO00116 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGPSO00116 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGPSO00116 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGPSO00116 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGPSO00116 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGPSO00116 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGPSO00116 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms