Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KT08 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KT08 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3KT08 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3KT08 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3KT08 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3KT08 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3KT08 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3KT08 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3KT08 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3KT08 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3KT08 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3KT08 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3KT08 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3KT08 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3KT08 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3KT08 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3KT08 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3KT08 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3KT08 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3KT08 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3KT08 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3KT08 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3KT08 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3KT08 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3KT08 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3KT08 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3KT08 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3KT08 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3KT08 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3KT08 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3KT08 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3KT08 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3KT08 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3KT08 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3KT08 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3KT08 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3KT08 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3KT08 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3KT08 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3KT08 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3KT08 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3KT08 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3KT08 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3KT08 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3KT08 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3KT08 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3KT08 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
J3KT08 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
J3KT08 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
J3KT08 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
J3KT08 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
J3KT08 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
J3KT08 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
J3KT08 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms