Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C1H1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C1H1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C1H1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C1H1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C1H1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C1H1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C1H1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C1H1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C1H1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C1H1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C1H1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C1H1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C1H1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C1H1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C1H1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C1H1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C1H1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C1H1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C1H1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C1H1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C1H1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C1H1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C1H1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H7C1H1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C1H1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C1H1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C1H1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C1H1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C1H1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C1H1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C1H1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C1H1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C1H1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C1H1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C1H1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H7C1H1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H7C1H1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H7C1H1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
H7C1H1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H7C1H1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C1H1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C1H1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C1H1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C1H1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C1H1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C1H1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C1H1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C1H1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C1H1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C1H1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C1H1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C1H1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C1H1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C1H1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H7C1H1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H7C1H1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H7C1H1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H7C1H1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H7C1H1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H7C1H1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H7C1H1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms