Protein–RNA interactions for Protein: F8VWA3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VWA3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
F8VWA3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
F8VWA3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
F8VWA3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
F8VWA3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
F8VWA3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
F8VWA3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
F8VWA3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
F8VWA3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
F8VWA3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
F8VWA3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8VWA3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8VWA3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
F8VWA3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8VWA3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8VWA3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8VWA3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8VWA3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
F8VWA3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8VWA3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8VWA3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8VWA3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8VWA3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8VWA3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
F8VWA3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8VWA3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8VWA3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8VWA3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8VWA3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8VWA3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8VWA3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8VWA3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8VWA3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
F8VWA3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
F8VWA3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8VWA3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8VWA3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8VWA3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8VWA3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8VWA3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8VWA3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8VWA3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
F8VWA3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
F8VWA3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8VWA3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8VWA3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
F8VWA3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8VWA3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8VWA3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8VWA3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8VWA3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8VWA3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8VWA3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8VWA3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8VWA3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
F8VWA3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8VWA3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8VWA3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8VWA3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8VWA3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8VWA3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8VWA3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8VWA3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8VWA3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8VWA3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8VWA3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8VWA3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
F8VWA3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8VWA3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8VWA3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8VWA3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8VWA3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8VWA3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8VWA3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8VWA3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8VWA3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8VWA3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
F8VWA3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8VWA3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
F8VWA3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8VWA3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8VWA3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
F8VWA3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
F8VWA3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8VWA3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8VWA3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8VWA3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8VWA3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8VWA3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8VWA3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8VWA3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8VWA3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8VWA3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8VWA3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8VWA3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8VWA3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8VWA3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8VWA3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8VWA3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8VWA3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms