Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DEV8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DEV8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DEV8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DEV8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DEV8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DEV8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DEV8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DEV8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DEV8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DEV8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DEV8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DEV8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DEV8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DEV8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DEV8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
B4DEV8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4DEV8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4DEV8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4DEV8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4DEV8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
B4DEV8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DEV8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DEV8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DEV8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DEV8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DEV8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DEV8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DEV8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DEV8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DEV8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DEV8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DEV8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
B4DEV8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DEV8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DEV8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DEV8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DEV8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DEV8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DEV8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DEV8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DEV8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DEV8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DEV8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DEV8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DEV8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DEV8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DEV8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DEV8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DEV8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DEV8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DEV8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DEV8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DEV8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DEV8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DEV8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DEV8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DEV8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DEV8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DEV8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DEV8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DEV8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DEV8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DEV8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DEV8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DEV8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DEV8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DEV8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DEV8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DEV8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DEV8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DEV8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DEV8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DEV8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DEV8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DEV8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DEV8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DEV8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DEV8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DEV8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms