Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NOTOA8MTQ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NOTOA8MTQ0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms