Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEIS3P2A8K0S8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3P2A8K0S8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms