Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
POTEFA5A3E0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POTEFA5A3E0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms