Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCHNA4D1U4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms