Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRD1A4D1F6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRD1A4D1F6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms