Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMX2A2RU54 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms