Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F8A0AVK6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
E2F8A0AVK6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F8A0AVK6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms