Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVT2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVT2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
A0A1B0GVT2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A1B0GVT2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms