Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GTW7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GTW7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms