Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
A0A0D9SFI3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
A0A0D9SFI3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A0D9SFI3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A0D9SFI3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A0D9SFI3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A0D9SFI3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A0D9SFI3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A0D9SFI3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A0D9SFI3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms