Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

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Length 1,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP2Q9UDT6 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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