Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ELMO1-201ENST00000310758 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AGGF1-201ENST00000312916 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ZNF544-208ENST00000596825 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TTC16-201ENST00000373289 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PAFAH1B2-204ENST00000527958 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 DDR1-224ENST00000376567 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 KCNH6-201ENST00000314672 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 RALA-201ENST00000005257 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 OR2B11-202ENST00000641149 6414 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PLEKHA6-205ENST00000637508 5704 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 VWC2-201ENST00000340652 11299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 EIF4E3-205ENST00000448225 6209 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 MFAP3L-201ENST00000361618 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CDC14A-201ENST00000336454 4137 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 LCMT2-201ENST00000305641 6957 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PTGFR-202ENST00000370757 4379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 RHBDL3-201ENST00000269051 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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