Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NICN1Q9BSH3 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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