Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 UGT1A5-201ENST00000373414 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CAPZA3Q96KX2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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CAPZA3Q96KX2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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CAPZA3Q96KX2 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CAPZA3Q96KX2 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CAPZA3Q96KX2 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CAPZA3Q96KX2 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CAPZA3Q96KX2 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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CAPZA3Q96KX2 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAPZA3Q96KX2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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