Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SETDB2-203ENST00000354234 6139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ERBB2-219ENST00000584601 4792 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 IL1R2-201ENST00000332549 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 RNF144B-201ENST00000259939 5036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PRKAG1-205ENST00000547306 1531 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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