Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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