Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTGS1P23219 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms