Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms