Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms