Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 UNC45B-203ENST00000591048 2553 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TM2D1-202ENST00000371177 3218 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HMOX2-203ENST00000406590 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PARP8-220ENST00000514342 2384 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FANCM-208ENST00000556036 2354 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GRIPAP1-201ENST00000376423 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ITSN1-201ENST00000379960 3026 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02211-203ENST00000642022 2816 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 QRSL1-201ENST00000369044 2158 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 2158 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HOPX-205ENST00000420433 1543 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DCK-204ENST00000504952 2614 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 Z94160.1-201ENST00000445088 1965 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00052-201ENST00000560153 1966 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF501-201ENST00000396048 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MMS19-203ENST00000370782 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NRF1-201ENST00000223190 2424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DCAF11-203ENST00000396941 2402 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SLC7A7-204ENST00000397532 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NUP62-201ENST00000352066 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AMIGO2-203ENST00000550413 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CR1L-203ENST00000508064 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LILRB3-202ENST00000346401 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN6-201ENST00000373020 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 Z98259.3-202ENST00000641860 2210 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL512383.1-201ENST00000624175 2677 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TNXB-203ENST00000451343 3125 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 UGT1A6-201ENST00000305139 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZC3H12C-203ENST00000528673 2931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CLSTN3-207ENST00000537408 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GANAB-216ENST00000540933 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC009159.4-201ENST00000624606 2031 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FLVCR2-201ENST00000238667 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SUSD4-207ENST00000484758 2736 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PADI4-201ENST00000375448 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PRR5L-216ENST00000530639 2291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC105219.4-201ENST00000529743 1809 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 C1S-203ENST00000402681 2522 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PDE4C-203ENST00000447275 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC113208.3-201ENST00000637356 2523 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms