Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 FAM184A-211ENST00000521531 3244 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 AC090136.3-201ENST00000520834 2704 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 DNAI2-201ENST00000311014 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 RUNX2-AS1-201ENST00000563807 1513 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
POLR2KP53803 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 IL1R2-202ENST00000393414 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms