Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNFSF9P41273 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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