Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 SALL1-204ENST00000566102 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 ZNF114-201ENST00000315849 2206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 PLXNA4-203ENST00000378539 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 TSPEAR-AS2-201ENST00000330490 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 CITED1-206ENST00000431381 941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 CITED1-207ENST00000445983 820 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 CDK2AP2P2-201ENST00000478512 367 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 MYOZ3-205ENST00000520112 605 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 AL606834.1-201ENST00000553836 1169 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 FHL2-208ENST00000409807 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 KRTAP10-10-201ENST00000380095 1100 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 CD33-202ENST00000391796 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 AL662860.1-201ENST00000436804 877 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 AC069181.1-201ENST00000498256 554 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 AL138828.1-208ENST00000585946 824 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 HYLS1-201ENST00000356438 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 AL078621.2-201ENST00000419351 698 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 AC104440.1-201ENST00000605010 343 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HECW1Q76N89 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms