Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 FTLP16-201ENST00000446400 513 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 MARVELD3-205ENST00000567501 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC023830.3-201ENST00000612995 1455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 FPGT-205ENST00000482102 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 UGT1A6-202ENST00000373424 1128 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC004884.1-201ENST00000393647 319 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 KIR3DL3-201ENST00000291860 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC012615.6-203ENST00000590531 272 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 FAM231B-201ENST00000600179 510 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 LINC00869-208ENST00000621156 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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