Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMTNP53814 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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