Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MCAMP43121 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCAMP43121 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCAMP43121 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms