Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMPOP42166 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms