Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
EPHA1P21709 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms