Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LTAP01374 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LTAP01374 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LTAP01374 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LTAP01374 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LTAP01374 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LTAP01374 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LTAP01374 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 EFHC1-224ENST00000636702 2197 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 DNAI2-201ENST00000311014 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LTAP01374 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 RHBDL2-201ENST00000289248 2129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 HACD3-210ENST00000568793 1824 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 AC120114.4-201ENST00000623731 2194 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LTAP01374 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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