Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 SNX12-207ENST00000622277 2422 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 RNF214-205ENST00000531287 1706 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CDKL2-201ENST00000307465 2565 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 GRHL3-201ENST00000236255 1870 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ALOX5-201ENST00000374391 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CAT-201ENST00000241052 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 PJA1-204ENST00000374584 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 PPP4R3A-206ENST00000554943 3369 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 NPIPP1-202ENST00000534799 1214 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ADGRF3-202ENST00000333478 3896 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 KIF22-202ENST00000400751 2493 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 IMPDH1P8-201ENST00000413639 1525 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 AC007598.3-201ENST00000623077 1678 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SPATA13-205ENST00000409126 2111 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 PDHA1-206ENST00000422285 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CDH3-202ENST00000429102 3611 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 PPP3CB-204ENST00000394829 3149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 NEFM-204ENST00000518131 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D3I-203ENST00000621034 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 HADH-210ENST00000626637 1774 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 BCL6-211ENST00000621333 3399 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SPTLC1-201ENST00000262554 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 LINC00452-202ENST00000609661 2896 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 LRRC8E-206ENST00000618098 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 YWHAB-202ENST00000372839 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TNFSF18Q9UNG2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms