Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMG20BQ9P0W2 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms