Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AFG3L2P1-201ENST00000521792 1763 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms