Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PCDH12-201ENST00000231484 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC023355.1-202ENST00000612262 4242 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SCN5A-207ENST00000449557 5898 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CEP89-201ENST00000305768 5678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PARP15-205ENST00000483793 4439 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 KLHL3-207ENST00000506491 6566 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RETNLBQ9BQ08 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms