Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms