Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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TNFSF9P41273 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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