Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC105935.1-203ENST00000419183 600 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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