Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 BTN3A2-202ENST00000377708 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms