Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PF4P02776 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PF4P02776 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PF4P02776 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PF4P02776 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 EXOSC2-203ENST00000372352 1957 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 AR-201ENST00000374690 10652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PF4P02776 NEK1-201ENST00000439128 5653 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PF4P02776 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PF4P02776 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PF4P02776 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PF4P02776 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PF4P02776 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PF4P02776 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PF4P02776 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PF4P02776 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PF4P02776 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PF4P02776 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PF4P02776 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PF4P02776 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PF4P02776 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 KCNV1-202ENST00000524391 6979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PF4P02776 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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