Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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TRAF6Q9Y4K3 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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TRAF6Q9Y4K3 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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TRAF6Q9Y4K3 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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TRAF6Q9Y4K3 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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TRAF6Q9Y4K3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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TRAF6Q9Y4K3 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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TRAF6Q9Y4K3 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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TRAF6Q9Y4K3 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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TRAF6Q9Y4K3 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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TRAF6Q9Y4K3 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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TRAF6Q9Y4K3 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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