Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 SYP-AS1-201ENST00000433499 542 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AC046143.1-201ENST00000447139 972 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AL929472.4-201ENST00000447422 691 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 FGL1-206ENST00000518650 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AC003005.2-201ENST00000595422 539 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 MIR6776-201ENST00000616678 59 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 ABCB4-201ENST00000265723 4020 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 SYCE1-201ENST00000303903 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 OR2T34-201ENST00000328782 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 OR2T3-201ENST00000359594 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 RCL1-203ENST00000381732 804 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 IGKV6-21-201ENST00000390256 406 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 EXOC7-206ENST00000406660 718 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AC004231.1-201ENST00000418393 815 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 EHF-209ENST00000531728 485 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AC092745.1-201ENST00000535746 603 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AC013356.4-201ENST00000558421 482 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AC008870.3-201ENST00000566143 641 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 ZNF124-201ENST00000340684 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 OR10D5P-201ENST00000392760 915 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AL031727.2-201ENST00000416470 207 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 HTR4-210ENST00000521735 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AP003469.2-201ENST00000524369 430 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 LINC02166-201ENST00000567544 721 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AC090376.1-202ENST00000587276 470 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AC012313.9-201ENST00000619318 633 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 NPL-205ENST00000367555 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 MAGEB1-201ENST00000378981 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 CHI3L2-202ENST00000369748 1468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AC025538.1-201ENST00000510707 1486 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 SLURP1-201ENST00000246515 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms