Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 BX005132.1-201ENST00000641403 1580 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 BCRP5-201ENST00000514371 253 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 MAF1-204ENST00000532522 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 DMRTC1-201ENST00000595412 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 KIR2DL4-204ENST00000359085 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 CDCA4P3-201ENST00000442572 689 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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