Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ATG7-202ENST00000354956 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ASAH1-202ENST00000314146 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TKTL1-202ENST00000369915 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC098650.1-201ENST00000635992 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PRPH2-201ENST00000230381 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 CRP-201ENST00000255030 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TMUB2-203ENST00000446571 1580 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ZBTB1-203ENST00000554015 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 VPS33B-201ENST00000333371 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 NT5E-201ENST00000257770 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 C12orf56-201ENST00000333722 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 HERC2P3-208ENST00000430598 4279 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LINC01913-201ENST00000398796 1810 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 NBPF1-204ENST00000432949 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TMEM174-201ENST00000296776 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AL590552.1-201ENST00000623164 1770 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 NUP62-201ENST00000352066 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ADGRG5-202ENST00000349457 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ALOX5-207ENST00000542434 2390 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 NPIPP1-202ENST00000534799 1214 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 C10orf90-201ENST00000284694 3076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 HSPA8P7-201ENST00000443628 1948 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CFAP52-201ENST00000352665 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CSF3R-202ENST00000361632 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 BRD9-204ENST00000483173 2120 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 UGT1A3-201ENST00000482026 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SLC45A4-201ENST00000024061 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 LMX1A-202ENST00000342310 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ATP2A1-201ENST00000357084 3532 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PAX6-208ENST00000379132 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SEC14L2-214ENST00000615189 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 LINC02080-201ENST00000585863 3085 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 BGN-201ENST00000331595 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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