Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms